Сейчас у Вас уже нормально всё грузится?
Предполагаю могли быть такие проблемы с клиентом из-за перебоев работы хостинга.

Прокоментирую отдельные моменты:

Необходимо больше инструментов при редактировании скриншотов !перед отправкой на сервер, сейчас в редакторе "выделенной области" совсем сыро, а полный снимок почему-то нельзя отредактировать, нужны такие инструменты как размытие больших областей скриншота(рамкой с угла в угол, произвольные выделения областей - после обрисовки выскакивает контур + возможность указать процент размытия), отдельно инструмент палец с для размазывания всего конфиденциального с заданием ширины захвата, инструмент ластик(сейчас какой-то странный), 

Инструменты будут расширены со временем. Сейчас у меня завал с основной работой, поэтому времени остаётся немного и выход версий замедлился. Впрочем, это не значит что их вовсе не будет. Мы надеемся порадовать пользователей новыми фичами и улучшениями ещё не раз, так что - Stay tuned! - как говорится. :)

- при автозагрузке(автологине), мелькает окно - зачем? 

Это происходит потому, что в случае невозможности авторизации окно останется открытым. Скрывается оно лишь при установленной настройке скрытия и прохождении авторизации. Но это действительно немного некорректное поведение - будет подправлено.

- слабо отзывчивый интерфейс редактора - все медленно, подсказки появляются за несколько сек и еще столько же затухают(толи в общем такие медленные эффекты хз, нужно как минимум в три раза быстрее), или отключать подсказки совсем. 

Редактор действительно сырой и, на данный момент, весьма тормознутый. Это заметно даже на весьма высокопроизводительных машинах. Это связано с рядом проблем в реализации - в скором времени они обязательно будут устранены (скорее всего через версию). 

- нажал кнопку инструмента и нужно ее отжать чтобы закрылось, хмм..? 

Согласен, весьма нестандартное поведение, будет изменено в дальнейшем.

- опция "загружать на сервер после подтверждения" - требует скрытого подтверждения, нужно лезть в скриншотер и жать кнопки, а почему бы сразу не выбрасывать алерт к примеру?, а можно даже так: скриншотим - выбрасываем окно(подопционально)  с кнопками: 
а) отправить без изменений 
б) редактировать и отправить 
в) не отправлять. 

Вариант с опциями мне очень понравился - спасибо за идею. Обязательно доделаем.

- нужно как-то быстрее отдавать окно с вариантами ссылок последнего скрина(например всплывающее окно в трее с одноименными кнопками для копирования ссылок). 
вот как-то так. 

Сейчас можно настроить приложение так, чтобы в клипборд сразу копировался код (коды) последних загруженных изображений, при этом, если приложение закрыто, в трее будет всплывать уведомление как только изображение загрузилось и ссылка скопировалась в клипборд. 

Насчёт скорости - дело в том, что получить ссылку раньше чем изображение будет загружено на сервер - невозможно в связи с реализацией хостинга. Или же речь шла о чём-то другом? Окно с кодами у меня открывается мгновенно при выборе изображения(ий), от которых вы хотите получить коды.

В последней версии, естественно, короткий код уже добвлен как один из вариантов.

Нет, но это никак не связано с самой иконкой, а скорее с поддержкой трея в Java на ОС Ubuntu - я ещё посмотрю есть ли возможность избавиться от навязчивого фона.

Да, действительно, есть такой косяк :)

Так и не смог найти где бы такое могло случиться.

Насчёт клавиши "win" - по ней будет срабатывать только если установить её как хоткей. Вероятно вы случайно его установили?

А на что конкретно хочется поменять иконку?) И зачем это потребовалось?

Насчёт хранения изображений в temp'е - так оно и есть. В ближайшей версии добавлю настройку директории хранения закэшированных изображений. Плюс, думаю, стоит по умолчанию сделать директорию хранения картинок той же, что и настроек. Просто необходимо более аккуратно (приложению а не Вам, если что) следить за порядком этих файлов.

Вообще - в user-home директории (обычно там любой пользователь и приложения имеют права на запись-чтение).

В windows это "C:\Users\<user>\.nhk". В MacOS - "/usr/<user>/.nhk", на линухах думаю тоже что-то типа того. Настройки сохраняются в несколько файлов в папку ".nhk".